MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinosynnema mirum DSM 43827 chromosome

Total Repeats: 230497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013093	ACC	2	6	105	110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374161
2	NC_013093	GGT	2	6	139	144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374161
3	NC_013093	GGA	2	6	145	150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374161
4	NC_013093	GCA	2	6	190	195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374161
5	NC_013093	GC	3	6	196	201	0 %	0 %	50 %	50 %	256374161
6	NC_013093	CCGA	2	8	217	224	25 %	0 %	25 %	50 %	256374161
7	NC_013093	GACGG	2	10	236	245	20 %	0 %	60 %	20 %	256374161
8	NC_013093	AGG	2	6	276	281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374161
9	NC_013093	CG	3	6	338	343	0 %	0 %	50 %	50 %	256374161
10	NC_013093	TCGC	2	8	347	354	0 %	25 %	25 %	50 %	256374161
11	NC_013093	GCC	2	6	376	381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374161
12	NC_013093	CGA	2	6	399	404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374161
13	NC_013093	GCC	2	6	424	429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374161
14	NC_013093	CCG	2	6	434	439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374161
15	NC_013093	CAG	2	6	467	472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374161
16	NC_013093	CCG	2	6	545	550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374161
17	NC_013093	AGC	2	6	579	584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374161
18	NC_013093	GGA	2	6	634	639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374161
19	NC_013093	CGA	2	6	643	648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374161
20	NC_013093	GCGG	2	8	704	711	0 %	0 %	75 %	25 %	256374161
21	NC_013093	CCG	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374161
22	NC_013093	CGG	3	9	840	848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374161
23	NC_013093	ACGA	2	8	1004	1011	50 %	0 %	25 %	25 %	256374161
24	NC_013093	TCA	2	6	1014	1019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374161
25	NC_013093	CGA	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374161
26	NC_013093	TCC	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374161
27	NC_013093	GAC	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374161
28	NC_013093	AGG	2	6	1113	1118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374161
29	NC_013093	AGG	2	6	1125	1130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374161
30	NC_013093	TTC	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256374161
31	NC_013093	GTG	2	6	1178	1183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374161
32	NC_013093	GCC	2	6	1195	1200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374161
33	NC_013093	GGA	2	6	1219	1224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374161
34	NC_013093	TCA	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374161
35	NC_013093	GCC	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374161
36	NC_013093	GAA	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256374161
37	NC_013093	GGC	2	6	1330	1335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374161
38	NC_013093	CCG	2	6	1338	1343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374161
39	NC_013093	GTG	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374161
40	NC_013093	GC	3	6	1398	1403	0 %	0 %	50 %	50 %	256374161
41	NC_013093	TGC	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374161
42	NC_013093	CAT	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374161
43	NC_013093	CCG	2	6	1536	1541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374161
44	NC_013093	TTC	2	6	1544	1549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256374161
45	NC_013093	CGG	2	6	1675	1680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374161
46	NC_013093	ACCAC	2	10	1686	1695	40 %	0 %	0 %	60 %	256374161
47	NC_013093	AAG	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256374161
48	NC_013093	AGC	2	6	1785	1790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374161
49	NC_013093	TGG	2	6	1803	1808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374161
50	NC_013093	C	7	7	1809	1815	0 %	0 %	0 %	100 %	256374161
51	NC_013093	GACCT	2	10	1825	1834	20 %	20 %	20 %	40 %	256374161
52	NC_013093	GCC	2	6	2699	2704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374162
53	NC_013093	CGG	2	6	2717	2722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374162
54	NC_013093	GGA	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374162
55	NC_013093	GCG	2	6	2806	2811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374162
56	NC_013093	CCA	2	6	2818	2823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374162
57	NC_013093	CGG	2	6	2831	2836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374162
58	NC_013093	ACC	2	6	2890	2895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374162
59	NC_013093	CGG	2	6	3067	3072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374162
60	NC_013093	GAC	2	6	3078	3083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374162
61	NC_013093	CTCGTC	2	12	3132	3143	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256374162
62	NC_013093	ACCG	2	8	3147	3154	25 %	0 %	25 %	50 %	256374162
63	NC_013093	CGA	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374162
64	NC_013093	CGC	2	6	3293	3298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374162
65	NC_013093	ACG	2	6	3301	3306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374162
66	NC_013093	CCT	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374162
67	NC_013093	GCC	2	6	3331	3336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374162
68	NC_013093	CAC	3	9	3338	3346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374162
69	NC_013093	GCT	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374162
70	NC_013093	GCT	2	6	3383	3388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374162
71	NC_013093	CCG	3	9	3403	3411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374162
72	NC_013093	ATC	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374162
73	NC_013093	TGG	2	6	3460	3465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374162
74	NC_013093	GAC	2	6	3531	3536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374162
75	NC_013093	GAG	3	9	3549	3557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374162
76	NC_013093	CCT	2	6	3611	3616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374162
77	NC_013093	CAC	2	6	3662	3667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374162
78	NC_013093	CAG	2	6	3671	3676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374162
79	NC_013093	TCG	2	6	3819	3824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374163
80	NC_013093	CCG	2	6	3862	3867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374163
81	NC_013093	GTC	2	6	3881	3886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374163
82	NC_013093	TCGC	2	8	3923	3930	0 %	25 %	25 %	50 %	256374163
83	NC_013093	GGT	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374163
84	NC_013093	CCG	2	6	3981	3986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374163
85	NC_013093	CGG	2	6	4054	4059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374163
86	NC_013093	CGA	2	6	4075	4080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374163
87	NC_013093	CGC	2	6	4090	4095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374163
88	NC_013093	GCG	2	6	4131	4136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374163
89	NC_013093	CGG	2	6	4141	4146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374163
90	NC_013093	CGG	2	6	4183	4188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374163
91	NC_013093	GC	3	6	4207	4212	0 %	0 %	50 %	50 %	256374163
92	NC_013093	CG	3	6	4248	4253	0 %	0 %	50 %	50 %	256374163
93	NC_013093	AGG	2	6	4254	4259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374163
94	NC_013093	CCA	2	6	4398	4403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374163
95	NC_013093	CGT	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374163
96	NC_013093	GCT	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374163
97	NC_013093	CTG	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374163
98	NC_013093	GAC	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374163
99	NC_013093	GAG	2	6	4538	4543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374163
100	NC_013093	CCG	2	6	4578	4583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374163
101	NC_013093	TCGCG	2	10	4599	4608	0 %	20 %	40 %	40 %	256374163
102	NC_013093	CGCC	2	8	4620	4627	0 %	0 %	25 %	75 %	256374163
103	NC_013093	GC	3	6	4630	4635	0 %	0 %	50 %	50 %	256374163
104	NC_013093	GGC	2	6	4639	4644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374163
105	NC_013093	CGG	2	6	4660	4665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374163
106	NC_013093	TCC	2	6	4691	4696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374163
107	NC_013093	GCA	2	6	4704	4709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374163
108	NC_013093	GGTC	2	8	4811	4818	0 %	25 %	50 %	25 %	256374164
109	NC_013093	CGC	2	6	4900	4905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374164
110	NC_013093	GCG	2	6	4915	4920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374164
111	NC_013093	GC	3	6	4925	4930	0 %	0 %	50 %	50 %	256374164
112	NC_013093	CGT	2	6	4931	4936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374164
113	NC_013093	CGG	2	6	4942	4947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374164
114	NC_013093	CTC	2	6	4968	4973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374164
115	NC_013093	GGA	2	6	5084	5089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374164
116	NC_013093	GCT	2	6	5141	5146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374164
117	NC_013093	TGC	2	6	5197	5202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374164
118	NC_013093	GCT	2	6	5216	5221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374164
119	NC_013093	CGG	2	6	5245	5250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374164
120	NC_013093	GCT	2	6	5303	5308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374164
121	NC_013093	CGC	2	6	5330	5335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374164
122	NC_013093	CGC	4	12	5348	5359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374164
123	NC_013093	GCT	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374164
124	NC_013093	GCAC	2	8	5434	5441	25 %	0 %	25 %	50 %	256374164
125	NC_013093	GGA	2	6	5456	5461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374164
126	NC_013093	GCT	2	6	5465	5470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374164
127	NC_013093	GAC	2	6	5538	5543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374164
128	NC_013093	GCCA	2	8	5583	5590	25 %	0 %	25 %	50 %	256374164
129	NC_013093	TCGCGC	2	12	5608	5619	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256374164
130	NC_013093	GCT	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374164
131	NC_013093	GAG	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374164
132	NC_013093	GGTGCT	2	12	5666	5677	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256374164
133	NC_013093	CGA	2	6	5678	5683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374164
134	NC_013093	GGC	3	9	5710	5718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374164
135	NC_013093	CGG	2	6	5737	5742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374164
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138	NC_013093	GAG	2	6	5787	5792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374164
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141	NC_013093	GC	3	6	6042	6047	0 %	0 %	50 %	50 %	256374165
142	NC_013093	CGG	2	6	6051	6056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374165
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254	NC_013093	CCG	2	6	10043	10048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374167
255	NC_013093	GGC	2	6	10052	10057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374167
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258	NC_013093	GCT	2	6	10169	10174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374167
259	NC_013093	TCG	2	6	10180	10185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374167
260	NC_013093	CGA	2	6	10196	10201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374167
261	NC_013093	GGA	2	6	10244	10249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374167
262	NC_013093	GTC	2	6	10272	10277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374167
263	NC_013093	GACC	2	8	10313	10320	25 %	0 %	25 %	50 %	256374167
264	NC_013093	GCG	2	6	10339	10344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374167
265	NC_013093	GC	3	6	10360	10365	0 %	0 %	50 %	50 %	256374167
266	NC_013093	GAC	2	6	10377	10382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374167
267	NC_013093	GCA	2	6	10388	10393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374167
268	NC_013093	CTT	2	6	10394	10399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256374167
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270	NC_013093	TTC	2	6	10428	10433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256374167
271	NC_013093	CAA	2	6	10436	10441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256374167
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273	NC_013093	CCT	2	6	10517	10522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374167
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276	NC_013093	CGG	2	6	10658	10663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374167
277	NC_013093	GAG	2	6	10686	10691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374167
278	NC_013093	CGA	2	6	10727	10732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374167
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280	NC_013093	CGA	2	6	10781	10786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374167
281	NC_013093	CG	3	6	10806	10811	0 %	0 %	50 %	50 %	256374167
282	NC_013093	CGA	3	9	10844	10852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374167
283	NC_013093	GCT	2	6	10853	10858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374167
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285	NC_013093	GGGGC	2	10	10952	10961	0 %	0 %	80 %	20 %	256374167
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291	NC_013093	CCG	2	6	11188	11193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374167
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294	NC_013093	GGC	2	6	11364	11369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374168
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296	NC_013093	GGA	2	6	11403	11408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374168
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384	NC_013093	AGG	2	6	15672	15677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374174
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498	NC_013093	G	6	6	21205	21210	0 %	0 %	100 %	0 %	256374181
499	NC_013093	TGC	2	6	21213	21218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
500	NC_013093	CCGG	2	8	21225	21232	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181

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